Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms