Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim6Q8BGE7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim6Q8BGE7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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