Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna11Q61716 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna11Q61716 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms