Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcolceQ61398 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PcolceQ61398 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PcolceQ61398 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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PcolceQ61398 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PcolceQ61398 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PcolceQ61398 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcolceQ61398 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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