Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chsy3Q5DTK1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chsy3Q5DTK1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms