Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12888Q3UW77 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm12888Q3UW77 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms