Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d1Q3UV55 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d1Q3UV55 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms