Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC2Q13868 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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