Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 ORC5YNL261W 1440 nt5.17□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.17□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 YOR024WYOR024W 324 nt5.17□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 MNS1YJR131W 1650 nt5.17□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 YNL247WYNL247W 2304 nt5.17□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 AIM17YHL021C 1398 nt5.16□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 DED81YHR019C 1665 nt5.16□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 RPL12AYEL054C 498 nt5.16□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 YJU2YKL095W 837 nt5.16□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 PGA3YML125C 939 nt5.16□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 BUB3YOR026W 1026 nt5.16□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 VMA13YPR036W 1437 nt5.15□□□□□ -1.58
YMR226CQ05016 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.15□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 XPT1YJR133W 630 nt5.15□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 RPS19BYNL302C 435 nt5.15□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 YNR048WYNR048W 1182 nt5.15□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 GPM3YOL056W 912 nt5.15□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 APM2YHL019C 1818 nt5.15□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 KIP2YPL155C 2121 nt5.15□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 PUS1YPL212C 1635 nt5.15□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 GEP3YOR205C 1671 nt5.15□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 QRI1YDL103C 1434 nt5.14□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 MRK1YDL079C 1506 nt5.14□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 CTR3YLR411W 726 nt5.14□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.14□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 MDY2YOL111C 639 nt5.14□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 HXT5YHR096C 1779 nt5.14□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 MGS1YNL218W 1764 nt5.14□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 SRG1SRG1 551 nt5.13□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 MOG1YJR074W 657 nt5.13□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 ZRT2YLR130C 1269 nt5.13□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 SHE10YGL228W 1734 nt5.13□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 ECM7YLR443W 1347 nt5.13□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 SCO1YBR037C 888 nt5.12□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 MSS116YDR194C 1995 nt5.12□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 BUD14YAR014C 2130 nt5.12□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 MCH4YOL119C 1506 nt5.12□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 NUD1YOR373W 2556 nt5.11□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 TAX4YJL083W 1815 nt5.11□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 ORM1YGR038W 669 nt5.11□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 GTO1YGR154C 1071 nt5.11□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 snR32snR32 188 nt5.11□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 CUE2YKL090W 1332 nt5.11□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 AAD4YDL243C 990 nt5.1□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 CTS1YLR286C 1689 nt5.1□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 SHM1YBR263W 1473 nt5.1□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 RPT1YKL145W 1404 nt5.09□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 RPS16BYDL083C 432 nt5.09□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 PHO86YJL117W 936 nt5.09□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 PPG1YNR032W 1107 nt5.09□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 snR10snR10 245 nt5.09□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 CKA2YOR061W 1020 nt5.09□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 ISU2YOR226C 471 nt5.09□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 YPL062WYPL062W 405 nt5.09□□□□□ -1.59
YMR226CQ05016 UGA1YGR019W 1416 nt5.08□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 NGR1YBR212W 2019 nt5.08□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.08□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 PRS2YER099C 957 nt5.08□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 NPT1YOR209C 1290 nt5.08□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 UBP9YER098W 2265 nt5.08□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 GAS3YMR215W 1575 nt5.08□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 STE7YDL159W 1548 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 PAL1YDR348C 1500 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 ARN2YHL047C 1863 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 ULA1YPL003W 1389 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 MMP1YLL061W 1752 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 YDR154CYDR154C 351 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 DFM1YDR411C 1026 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 URA3YEL021W 804 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 YER187WYER187W 426 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 PAN6YIL145C 930 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 CAM1YPL048W 1248 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 ENV7YPL236C 1095 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 DAL81YIR023W 2913 nt5.07□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 YMD8YML038C 1329 nt5.06□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 FYV1YDR024W 486 nt5.06□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 SFK1YKL051W 1062 nt5.06□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 ECM19YLR390W 339 nt5.06□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 PIN2YOR104W 849 nt5.06□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 ARB1YER036C 1833 nt5.06□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 TUL1YKL034W 2277 nt5.06□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 EXO1YOR033C 2109 nt5.05□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 PUF3YLL013C 2640 nt5.05□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 MHF2YDL160C-A 243 nt5.05□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 PHM8YER037W 966 nt5.05□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 RPL28YGL103W 450 nt5.05□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 SPO7YAL009W 780 nt5.05□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 NGL2YMR285C 1548 nt5.05□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 IPK1YDR315C 846 nt5.04□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 COG1YGL223C 1254 nt5.04□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 SED4YCR067C 3198 nt5.04□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 YHR045WYHR045W 1683 nt5.04□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 PDR10YOR328W 4695 nt5.04□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 SUA5YGL169W 1281 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.03□□□□□ -1.6
YMR226CQ05016 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms