Protein–RNA interactions for Protein: Q04370

PEX12, Peroxisome assembly protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX12Q04370 YDL144CYDL144C 1071 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 GAL83YER027C 1254 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 PHO86YJL117W 936 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 YKL107WYKL107W 930 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 RPA49YNL248C 1248 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 HES1YOR237W 1305 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 SLT2YHR030C 1455 nt5.12□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 COX26YDR119W-A 201 nt5.11□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 YOR024WYOR024W 324 nt5.11□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 MAL11YGR289C 1851 nt5.11□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 FRE3YOR381W 2136 nt5.11□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 KIP2YPL155C 2121 nt5.11□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 RIM15YFL033C 5313 nt5.1□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 TRP1YDR007W 675 nt5.1□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 YJL107CYJL107C 1164 nt5.1□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 CAM1YPL048W 1248 nt5.1□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 ARO10YDR380W 1908 nt5.09□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 YHR045WYHR045W 1683 nt5.09□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 YOR1YGR281W 4434 nt5.09□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 SNO4YMR322C 714 nt5.09□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 SCO1YBR037C 888 nt5.09□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 HSP33YOR391C 714 nt5.09□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 HSP32YPL280W 714 nt5.09□□□□□ -1.59
PEX12Q04370 ARN2YHL047C 1863 nt5.09□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 GLT1YDL171C 6438 nt5.08□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 NTH2YBR001C 2343 nt5.08□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 VMA13YPR036W 1437 nt5.08□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 ULA1YPL003W 1389 nt5.08□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.08□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 MCX1YBR227C 1563 nt5.08□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 YDL034WYDL034W 345 nt5.07□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 YDL121CYDL121C 450 nt5.07□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 XPT1YJR133W 630 nt5.07□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 YLL059CYLL059C 507 nt5.07□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 TUL1YKL034W 2277 nt5.06□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 NUD1YOR373W 2556 nt5.06□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 YGL185CYGL185C 1140 nt5.06□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 ROX3YBL093C 663 nt5.06□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 GDB1YPR184W 4611 nt5.06□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 YPL277CYPL277C 1464 nt5.06□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 CTS1YLR286C 1689 nt5.05□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 PUS1YPL212C 1635 nt5.05□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 TIF2YJL138C 1188 nt5.05□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 TIF1YKR059W 1188 nt5.05□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 CTR3YLR411W 726 nt5.05□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 LST8YNL006W 912 nt5.05□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 PEX32YBR168W 1242 nt5.05□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 MKC7YDR144C 1791 nt5.04□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 ATG20YDL113C 1923 nt5.04□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 GRX4YER174C 735 nt5.04□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 YJR085CYJR085C 318 nt5.04□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 ISU2YOR226C 471 nt5.04□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 ARR3YPR201W 1215 nt5.04□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 SIP5YMR140W 1470 nt5.04□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.03□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 CAD1YDR423C 1230 nt5.03□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 SCW4YGR279C 1161 nt5.03□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 TFS1YLR178C 660 nt5.03□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 CKA2YOR061W 1020 nt5.03□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 YPL041CYPL041C 624 nt5.03□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 CYK3YDL117W 2658 nt5.03□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 WTM2YOR229W 1404 nt5.03□□□□□ -1.6
PEX12Q04370 CUE2YKL090W 1332 nt5.02□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 GTO1YGR154C 1071 nt5.02□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 POR2YIL114C 846 nt5.02□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 DCI1YOR180C 816 nt5.02□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 ECM33YBR078W 1290 nt5.02□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 PDI1YCL043C 1569 nt5.02□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 KCH1YJR054W 1494 nt5.01□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 TOS4YLR183C 1470 nt5.01□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 RPT6YGL048C 1218 nt5.01□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 COS9YKL219W 1224 nt5.01□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 YML131WYML131W 1098 nt5.01□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 COX11YPL132W 903 nt5.01□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 SEC39YLR440C 2130 nt5□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 FET3YMR058W 1911 nt5□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 ERD1YDR414C 1089 nt5□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 URA3YEL021W 804 nt5□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 DBP8YHR169W 1296 nt5□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 MRPL36YBR122C 534 nt5□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 ARB1YER036C 1833 nt5□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 GRS1YBR121C 2004 nt4.99□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 MGS1YNL218W 1764 nt4.99□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 MCH4YOL119C 1506 nt4.99□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 UTR4YEL038W 684 nt4.99□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 RPL12AYEL054C 498 nt4.99□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 SHP1YBL058W 1272 nt4.99□□□□□ -1.61
PEX12Q04370 YNL019CYNL019C 855 nt4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms