Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl7Q03366 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl7Q03366 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl7Q03366 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl7Q03366 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl7Q03366 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl7Q03366 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl7Q03366 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl7Q03366 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms