Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd3P62320 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms