Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl8P59280 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl8P59280 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl8P59280 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms