Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FmodP50608 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FmodP50608 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FmodP50608 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FmodP50608 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FmodP50608 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FmodP50608 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FmodP50608 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FmodP50608 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FmodP50608 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FmodP50608 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FmodP50608 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FmodP50608 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FmodP50608 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FmodP50608 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FmodP50608 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FmodP50608 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FmodP50608 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FmodP50608 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FmodP50608 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FmodP50608 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FmodP50608 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FmodP50608 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FmodP50608 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FmodP50608 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FmodP50608 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FmodP50608 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FmodP50608 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FmodP50608 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FmodP50608 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FmodP50608 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FmodP50608 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FmodP50608 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FmodP50608 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FmodP50608 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FmodP50608 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FmodP50608 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FmodP50608 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FmodP50608 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FmodP50608 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FmodP50608 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FmodP50608 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FmodP50608 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FmodP50608 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FmodP50608 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FmodP50608 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FmodP50608 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FmodP50608 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FmodP50608 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FmodP50608 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FmodP50608 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FmodP50608 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FmodP50608 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FmodP50608 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FmodP50608 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FmodP50608 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FmodP50608 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FmodP50608 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FmodP50608 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FmodP50608 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FmodP50608 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FmodP50608 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FmodP50608 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FmodP50608 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FmodP50608 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FmodP50608 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FmodP50608 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FmodP50608 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FmodP50608 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FmodP50608 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FmodP50608 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FmodP50608 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FmodP50608 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FmodP50608 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FmodP50608 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FmodP50608 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FmodP50608 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms