Protein–RNA interactions for Protein: P38915

SPT8, Transcription factor SPT8, yeastyeast

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT8P38915 VPS72YDR485C 2388 nt5.88□□□□□ -1.47
SPT8P38915 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.88□□□□□ -1.47
SPT8P38915 YDL119CYDL119C 924 nt5.88□□□□□ -1.47
SPT8P38915 TRP1YDR007W 675 nt5.88□□□□□ -1.47
SPT8P38915 COS9YKL219W 1224 nt5.88□□□□□ -1.47
SPT8P38915 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.88□□□□□ -1.47
SPT8P38915 KDX1YKL161C 1302 nt5.88□□□□□ -1.47
SPT8P38915 SSZ1YHR064C 1617 nt5.88□□□□□ -1.47
SPT8P38915 CAD1YDR423C 1230 nt5.87□□□□□ -1.47
SPT8P38915 ERP5YHR110W 639 nt5.87□□□□□ -1.47
SPT8P38915 DCN1YLR128W 810 nt5.87□□□□□ -1.47
SPT8P38915 SPG4YMR107W 348 nt5.87□□□□□ -1.47
SPT8P38915 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.87□□□□□ -1.47
SPT8P38915 ENV9YOR246C 993 nt5.87□□□□□ -1.47
SPT8P38915 YHR045WYHR045W 1683 nt5.87□□□□□ -1.47
SPT8P38915 SSY5YJL156C 2100 nt5.87□□□□□ -1.47
SPT8P38915 QRI1YDL103C 1434 nt5.86□□□□□ -1.47
SPT8P38915 NQM1YGR043C 1002 nt5.86□□□□□ -1.47
SPT8P38915 JJJ3YJR097W 519 nt5.86□□□□□ -1.47
SPT8P38915 YLL059CYLL059C 507 nt5.86□□□□□ -1.47
SPT8P38915 CSL4YNL232W 879 nt5.86□□□□□ -1.47
SPT8P38915 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.86□□□□□ -1.47
SPT8P38915 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.86□□□□□ -1.47
SPT8P38915 OXP1YKL215C 3861 nt5.86□□□□□ -1.47
SPT8P38915 IES1YFL013C 2079 nt5.86□□□□□ -1.47
SPT8P38915 TAX4YJL083W 1815 nt5.85□□□□□ -1.47
SPT8P38915 QDR1YIL120W 1692 nt5.85□□□□□ -1.47
SPT8P38915 VAN1YML115C 1608 nt5.85□□□□□ -1.47
SPT8P38915 AVO1YOL078W 3531 nt5.85□□□□□ -1.47
SPT8P38915 MTF2YDL044C 1323 nt5.85□□□□□ -1.47
SPT8P38915 YDL172CYDL172C 480 nt5.85□□□□□ -1.47
SPT8P38915 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.85□□□□□ -1.47
SPT8P38915 RPS19BYNL302C 435 nt5.85□□□□□ -1.47
SPT8P38915 FRE3YOR381W 2136 nt5.85□□□□□ -1.47
SPT8P38915 TOS4YLR183C 1470 nt5.84□□□□□ -1.47
SPT8P38915 NOP7YGR103W 1818 nt5.84□□□□□ -1.47
SPT8P38915 ECM3YOR092W 1842 nt5.84□□□□□ -1.47
SPT8P38915 YKR041WYKR041W 753 nt5.84□□□□□ -1.47
SPT8P38915 DAL82YNL314W 768 nt5.84□□□□□ -1.47
SPT8P38915 PEX32YBR168W 1242 nt5.84□□□□□ -1.47
SPT8P38915 MKC7YDR144C 1791 nt5.83□□□□□ -1.48
SPT8P38915 BRF1YGR246C 1791 nt5.83□□□□□ -1.48
SPT8P38915 VHS1YDR247W 1386 nt5.83□□□□□ -1.48
SPT8P38915 RTT106YNL206C 1368 nt5.83□□□□□ -1.48
SPT8P38915 EIS1YMR031C 2532 nt5.83□□□□□ -1.48
SPT8P38915 PDE1YGL248W 1110 nt5.83□□□□□ -1.48
SPT8P38915 GPM3YOL056W 912 nt5.83□□□□□ -1.48
SPT8P38915 SPC97YHR172W 2472 nt5.83□□□□□ -1.48
SPT8P38915 DPH2YKL191W 1605 nt5.82□□□□□ -1.48
SPT8P38915 FOL1YNL256W 2475 nt5.82□□□□□ -1.48
SPT8P38915 RHO3YIL118W 696 nt5.82□□□□□ -1.48
SPT8P38915 RPA49YNL248C 1248 nt5.82□□□□□ -1.48
SPT8P38915 RNR3YIL066C 2610 nt5.82□□□□□ -1.48
SPT8P38915 ULA1YPL003W 1389 nt5.81□□□□□ -1.48
SPT8P38915 YKL107WYKL107W 930 nt5.81□□□□□ -1.48
SPT8P38915 LEM3YNL323W 1245 nt5.81□□□□□ -1.48
SPT8P38915 RRN3YKL125W 1884 nt5.81□□□□□ -1.48
SPT8P38915 HAP1YLR256W 4509 nt5.8□□□□□ -1.48
SPT8P38915 SIP5YMR140W 1470 nt5.8□□□□□ -1.48
SPT8P38915 MTW1YAL034W-A 870 nt5.8□□□□□ -1.48
SPT8P38915 ROX3YBL093C 663 nt5.8□□□□□ -1.48
SPT8P38915 YOR024WYOR024W 324 nt5.8□□□□□ -1.48
SPT8P38915 FLC3YGL139W 2409 nt5.8□□□□□ -1.48
SPT8P38915 ATG20YDL113C 1923 nt5.8□□□□□ -1.48
SPT8P38915 ATE1YGL017W 1512 nt5.79□□□□□ -1.48
SPT8P38915 CDC19YAL038W 1503 nt5.79□□□□□ -1.48
SPT8P38915 PDR16YNL231C 1056 nt5.79□□□□□ -1.48
SPT8P38915 DFG5YMR238W 1377 nt5.79□□□□□ -1.48
SPT8P38915 DBF4YDR052C 2115 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 KIP2YPL155C 2121 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 DAK1YML070W 1755 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 BPL1YDL141W 2073 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 RSC30YHR056C 2652 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 YDL121CYDL121C 450 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 CTR2YHR175W 570 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 YJR115WYJR115W 510 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 YJU2YKL095W 837 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 MTC2YKL098W 1074 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 YNL247WYNL247W 2304 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 CBC2YPL178W 627 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 AIM17YHL021C 1398 nt5.78□□□□□ -1.48
SPT8P38915 GIR2YDR152W 798 nt5.77□□□□□ -1.49
SPT8P38915 DON1YDR273W 1098 nt5.77□□□□□ -1.49
SPT8P38915 MRF1YGL143C 1242 nt5.77□□□□□ -1.49
SPT8P38915 SCO1YBR037C 888 nt5.77□□□□□ -1.49
SPT8P38915 NRM1YNR009W 750 nt5.76□□□□□ -1.49
SPT8P38915 COX11YPL132W 903 nt5.76□□□□□ -1.49
SPT8P38915 BIT2YBR270C 1638 nt5.76□□□□□ -1.49
SPT8P38915 SLT2YHR030C 1455 nt5.76□□□□□ -1.49
SPT8P38915 ECM7YLR443W 1347 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT8P38915 VMA13YPR036W 1437 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT8P38915 ORM1YGR038W 669 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT8P38915 EFM4YIL064W 774 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT8P38915 PGU1YJR153W 1086 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT8P38915 RIM15YFL033C 5313 nt5.75□□□□□ -1.49
SPT8P38915 RML2YEL050C 1182 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT8P38915 TDH3YGR192C 999 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT8P38915 YHR127WYHR127W 732 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT8P38915 YJL107CYJL107C 1164 nt5.74□□□□□ -1.49
SPT8P38915 MSS116YDR194C 1995 nt5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.1 ms