Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTAFRP25105 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms