Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DSPP15924 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DSPP15924 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSPP15924 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSPP15924 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSPP15924 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSPP15924 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSPP15924 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DSPP15924 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSPP15924 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSPP15924 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSPP15924 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSPP15924 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSPP15924 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSPP15924 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSPP15924 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSPP15924 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSPP15924 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSPP15924 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSPP15924 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSPP15924 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSPP15924 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSPP15924 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSPP15924 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSPP15924 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DSPP15924 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSPP15924 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSPP15924 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSPP15924 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSPP15924 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DSPP15924 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DSPP15924 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSPP15924 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSPP15924 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSPP15924 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSPP15924 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSPP15924 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSPP15924 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSPP15924 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSPP15924 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSPP15924 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSPP15924 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSPP15924 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DSPP15924 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSPP15924 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSPP15924 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSPP15924 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSPP15924 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSPP15924 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSPP15924 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSPP15924 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DSPP15924 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSPP15924 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSPP15924 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSPP15924 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSPP15924 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSPP15924 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSPP15924 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSPP15924 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSPP15924 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSPP15924 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DSPP15924 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSPP15924 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSPP15924 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSPP15924 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSPP15924 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSPP15924 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSPP15924 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSPP15924 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSPP15924 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSPP15924 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms