Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrphP15331 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrphP15331 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrphP15331 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrphP15331 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrphP15331 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrphP15331 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrphP15331 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrphP15331 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrphP15331 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrphP15331 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrphP15331 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrphP15331 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrphP15331 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PrphP15331 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrphP15331 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrphP15331 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrphP15331 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrphP15331 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrphP15331 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrphP15331 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrphP15331 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrphP15331 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrphP15331 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrphP15331 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrphP15331 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PrphP15331 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrphP15331 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrphP15331 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrphP15331 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrphP15331 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrphP15331 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrphP15331 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrphP15331 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrphP15331 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrphP15331 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrphP15331 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrphP15331 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrphP15331 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrphP15331 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrphP15331 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrphP15331 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrphP15331 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrphP15331 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrphP15331 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrphP15331 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrphP15331 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrphP15331 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrphP15331 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrphP15331 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrphP15331 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrphP15331 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrphP15331 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrphP15331 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrphP15331 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrphP15331 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrphP15331 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrphP15331 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrphP15331 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrphP15331 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrphP15331 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrphP15331 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrphP15331 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PrphP15331 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrphP15331 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrphP15331 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrphP15331 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrphP15331 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrphP15331 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrphP15331 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrphP15331 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrphP15331 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrphP15331 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrphP15331 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrphP15331 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrphP15331 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrphP15331 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrphP15331 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrphP15331 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrphP15331 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrphP15331 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms