Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sub1P11031 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sub1P11031 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sub1P11031 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sub1P11031 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sub1P11031 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sub1P11031 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms