Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa5P09021 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms