Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtrP07309 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TtrP07309 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtrP07309 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TtrP07309 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtrP07309 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtrP07309 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtrP07309 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtrP07309 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtrP07309 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtrP07309 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtrP07309 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtrP07309 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtrP07309 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtrP07309 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtrP07309 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TtrP07309 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TtrP07309 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TtrP07309 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtrP07309 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TtrP07309 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TtrP07309 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtrP07309 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtrP07309 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtrP07309 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TtrP07309 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtrP07309 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TtrP07309 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtrP07309 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtrP07309 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtrP07309 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TtrP07309 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtrP07309 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtrP07309 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtrP07309 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TtrP07309 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtrP07309 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TtrP07309 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtrP07309 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtrP07309 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TtrP07309 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TtrP07309 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtrP07309 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtrP07309 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtrP07309 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TtrP07309 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtrP07309 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TtrP07309 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtrP07309 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtrP07309 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtrP07309 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtrP07309 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtrP07309 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TtrP07309 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TtrP07309 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TtrP07309 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtrP07309 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtrP07309 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms