Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zkscan2G3X952 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zkscan2G3X952 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zkscan2G3X952 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms