Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp4A4UUI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp4A4UUI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp4A4UUI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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