Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc173A0JLY1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc173A0JLY1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms