Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
YIPF4Q9BSR8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
YIPF4Q9BSR8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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