Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms