Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms