Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTTNQ14247 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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