Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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BPTFQ12830 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPTFQ12830 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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