Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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FOXO1Q12778 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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FOXO1Q12778 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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FOXO1Q12778 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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