Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms