Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms