Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CABP4P57796 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CABP4P57796 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CABP4P57796 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CABP4P57796 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CABP4P57796 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CABP4P57796 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CABP4P57796 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CABP4P57796 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms