Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA1P20827 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms