Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TO15178 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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