Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TMIEQ8NEW7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TMIEQ8NEW7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TMIEQ8NEW7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TMIEQ8NEW7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TMIEQ8NEW7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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