Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST3Q8N1M1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BEST3Q8N1M1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST3Q8N1M1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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