Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms