Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5B1Q2VPB7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms