Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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