Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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