Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCIRG1Q13488 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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