Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNB1P35222 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms