Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MMP11P24347 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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MMP11P24347 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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MMP11P24347 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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MMP11P24347 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP11P24347 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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MMP11P24347 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MMP11P24347 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MMP11P24347 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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MMP11P24347 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP11P24347 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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