Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms