Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms