Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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HOXC10Q9NYD6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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HOXC10Q9NYD6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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