Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms