Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCAF6Q58WW2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms