Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CCDC6Q16204 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CCDC6Q16204 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CCDC6Q16204 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CCDC6Q16204 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CCDC6Q16204 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CCDC6Q16204 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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